En réalité, quand on y regarde, la plupart des catégories sont vraiment des microcatégories avec au plus une vingtaine de blogs. Sachant qu'un ou deux liens par mois assurent largement une place dans les 1500 premiers su classement wikio ( voir http://tomroud.com/2009/03/07/la-reponse-du-classement-wikio/ ), cela signifie vraiment que la blogosphère "spécialisée" soit ne se linke pas assez soit est bien trop petite.

A vue de nez, je dirai que c'est les deux. La masse critique n'est pas atteinte et les blogs de sciences n'ont pas cette démarche de "clique" comme tu l'as décrit dans ton article. Je pense d'ailleurs qu'il serait mal venu de se lier pour monter dans les classements. Ce sont à eux de s'adapter aux spécificités de leur objet! Pour ma part, je pense qu'un facteur de pondérartion devrait être appliqué au moins pour ne pas amplifier le phénomène. Il est clair que les blogs de maths peuvent difficilement lutter par exemple, à armes égales, avec des blogs politiques, ou de sport. Le réservoir des bloggueurs concernés n'est pas du tout le même, reproduisant à peu près sur la blogosphère, ce qui se passe dans la réalité avec les domaines concernés. Si effectivement rien n'est fait dans ce sens, il est clair que la science n'aura guère de visibilité ou du moins, les quelques bloggueurs passionnés devront arracher la notoriété dans la sueur.
L'idée de la Wikiopole me parait intéressante sauf si elle ne peux pas être consultée avec diférents filtres. Des curseurs de pondération me paraissent obligatoires!

Pour le rapport des effectifs entre catégories, un exemple peut être donné par Booster Blog, en bas de la page :
http://www.boosterblog.com/
104 blogs répertoriés "science" pour 76130 blogs répertoriés !